Modelul din 1966 era ușor de recunoscut extern prin emblema Mustang de pe grilă, care nu mai era „susținută” de bare cromate orizontale, și prin cele trei inserții cromate de pe fiecare dintre prizele de aer fictive din fața arcadelor roților spate. Caracteristicile de siguranță au fost extinse pentru a include centuri de siguranță față și spate, un panou de bord căptușit și lumini de avarie. Vitezometrul cu scalare orizontală utilizat în primul an de fabricație a fost înlocuit cu instrumente rotunde.

În doi ani și jumătate, au fost produse 1,1 milioane de unități ale modelului Mustang original, inclusiv 864.000 de coupe-uri cu hardtop, 105.000 de fastback-uri și 145.000 de decapotabile..